En esta entidad federativa se vivieron varios casos de violencia política, donde la mayoría fueron entre militantes de partidos políticos, teniendo un conteo de seis casos. Los municipios donde existieron indices de violencia fueron: Mérida, Samahail, Chankom, Tixcacalcupul, Tekantó, Telchac puertoy Chapab. Algunos ejemplos de esta situación se detallan a continuación:
- Se obtuvieron cinco casos de violencia entre militantes.
- Falleció un joven por causa de actos de violencia entre militantes.
- Una mujer militante del PRI fue atacada a machete en el rostro y cabeza por simpatizantes de Morena.
- Candidata de MORENA fue agredida por partidos contrarios.
- Candidata de Movimiento Ciudadano fue amenazada de muerte, exigiendo su renuncia a la contienda.
- Candidata interpone denuncia por amenazas e intimidación encabezadas por personas identificadas con el candidato de Morena