El programa de tutorías se define a partir de la línea de investigación establecida por el programa e inicia a partir del primer semestre en que los aspirantes presentan los protocolos de investigación. La figura responsable del acompañamiento de los proyectos de investigación es el director de tesis.

El director será un miembro del núcleo académico básico de enseñanza o investigación superior; a cada alumno le será asignado un Comité Tutorial, como parte del acompañamiento. El Director será el responsable de guiar y asesorar al estudiante durante el desarrollo del programa educativo, considerando hasta 4 alumnos tutorados por cada director de tesis. El programa exige un acompañamiento sistematizado y permanente durante todo el proceso formativo.